Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms