Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms