Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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