Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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PTPRCP08575 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRCP08575 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRCP08575 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRCP08575 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRCP08575 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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PTPRCP08575 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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PTPRCP08575 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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