Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
E2F8A0AVK6 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms