Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SBNO2Q9Y2G9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms