Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms