Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRPF3Q9ULD4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms