Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REREQ9P2R6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms