Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
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