Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms