Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms