Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms