Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms