Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELP3Q9H9T3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms