Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSTN2Q9H4D0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms