Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms