Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL13Q99616 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL13Q99616 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms