Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRNP1Q96S65 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRNP1Q96S65 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms