Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms