Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC43Q96MW1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC43Q96MW1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms