Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG3Q96JB2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms