Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms