Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MARVELD3Q96A59 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MARVELD3Q96A59 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms