Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms