Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms