Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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RAB11FIP4Q86YS3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP4Q86YS3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
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