Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM50Q86XT4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms