Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms