Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMCO2Q7Z6W1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms