Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms