Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM46CQ5VWP2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms