Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD1Q5SYB0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms