Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC93Q567U6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms