Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms