Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB5Q2M3G0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms