Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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