Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
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PTPRKQ15262 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
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PTPRKQ15262 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
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PTPRKQ15262 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
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PTPRKQ15262 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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PTPRKQ15262 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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PTPRKQ15262 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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PTPRKQ15262 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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PTPRKQ15262 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
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