Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms