Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE7AQ13946 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms