Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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