Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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