Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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C1orf61Q13536 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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C1orf61Q13536 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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C1orf61Q13536 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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C1orf61Q13536 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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