Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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