Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF2Q12947 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms