Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TRAF2Q12933 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TRAF2Q12933 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TRAF2Q12933 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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TRAF2Q12933 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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