Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
HMGXB3Q12766 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
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