Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms