Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms