Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms